昭忠祠始建于1885年,为纪念1884年8月23日(农历七月初三日)甲申中法马江海战死难烈士而建。民国年间,报请海军部将中日甲午战争中为国捐躯的中国海军将士牌位移入昭忠祠合祀,确立了昭忠祠作为中国近代海军英烈纪念专祠的特殊地位。1984年8月对外开放。1996年被公布为全国重点文物保护单位。